Давайте вспомним правила постановки ударения в глаголах и узнаем, куда падает ударение в слове «маркИровать» или «маркировАть».
Большинство лингвистов сходятся во мнении, что ударение в этом слове зависит от его значения: маркИровать (лингвистический термин) и маркировАть (ставить марку или проводить борозды).
В речи мы чаще всего слышим вариант в значении «ставить клеймо или марку» или «проводить борозды». В этих значениях ударным будет последний слог – маркировАть. В русском языке есть много глаголов с ударением на -ать: «баловАть», «премировАть», «нормировАть» и т.п.
Глагол «маркИровать» в лингвистике встречается редко. Как правило, языковеды используют производное от него причастие «маркИрованный».